不废话了，直接贴代码了。

代码如下：

<?php 
header('content-type:text/html;charset=gbk'); 
set_time_limit(0);//防止超时 
/** 
* 
* php目录扫描监控增强版 
* 
* @version 1.0 
* 
下面几个变量使用前需要手动设置 
* 
**/ 
/*===================== 程序配置 =====================*/ 
$pass="test";//设置密码 
$jkdir="."; //设置监控扫描的目录，当前目录为'.'，上一级目录为'..'，也可以设置绝对路径，后面不要加斜杠，默认为当前目录 
$logfilename="./m.log";//设置存储log的路径，可以放置在任意位置 
$exclude=array('data','images');//排除目录 
$danger='eval|cmd|passthru|gzuncompress';//设置要查找的危险的函数 以确定是否木马文件 
$suffix='php|inc';//设置要扫描文件的后缀 
/*===================== 配置结束 =====================*/ 
$filename=$_GET['filename']; 
$check=$_GET['check']; 
$jumpoff=false; 
$url = $_SERVER['PHP_SELF']; 
$thisfile = end(explode('/',$url)); 
$jump="{$thisfile}|".implode('|',$exclude); 
$jkdir_num=$file_num=$danger_num=0; 
define('M_PATH',$jkdir); 
define('M_LOG',$logfilename); 
if ($check=='check') 
{ 
$safearr = explode("|",$jump); 
$start_time=microtime(true); 
safe_check($jkdir); 
$end_time=microtime(true); 
$total=$end_time-$start_time; 
$file_num=$file_num-$jkdir_num; 
$message= " 文件数:".$file_num; 
$message.= " 文件夹数：".$jkdir_num; 
$message.= " 可疑文件数：".$danger_num; 
$message.= " 执行时间：".$total; 
echo $message; 
}else{ 
if ($_GET['m']=="del") Delete();//处理文件删除 
//读取文件内容 
if(isset($_GET['readfile'])){ 
//输出查看密码，密码校验正确以后输出文件内容 
if(empty($_POST['passchack'])){ 
  echo"<form id="form1" name="form1" method="post">" 
  . " <label>pass" 
  . " <input type="text" name="passchack" />" 
  . " </label>" 
  . " <input type="submit" name="Submit" value="提交" />" 
  . "</form>" 
  .""; 
  exit; 
}elseif(isset($_POST['passchack'])&&$_POST['passchack']==$pass){ 
  $code=file_get_contents($_GET['readfile']); 
  echo"<textarea name="code" cols="150" rows="30" id="code" style='width:100%;height:450px;background:#cccccc;'>{$code}</textarea>"; 
  exit; 
}else{ 
  exit; 
} 
}else{ 
record_md5(M_PATH); 
if(file_exists(M_LOG)){ 
    $log = unserialize(file_get_contents(M_LOG)); 
}else{ 
    $log = array(); 
} 
if($_GET['savethis']==1){ 
//保存当前文件md5到日志文件 
@unlink(M_LOG); 
file_put_contents(M_LOG,serialize($file_list)); 
echo "<a href='http://www.gimoo.net/t/1512/scandir.php'>保存成功！点击返回</a>"; 
exit; 
} 
if(empty($log)){ 
echo "当前还没有创建日志文件！点击[保存当前]创建日志文件！"; 
}else{ 
if($file_list==$log){ 
  echo "本文件夹没有做过任何改动！"; 
}else{ 
  if(count($file_list) > 0 ){ 
  foreach($file_list as $file => $md5){ 
  if(!isset($log[$file])){ 
   echo "新增文件：<a href={$file} target='_blank'>".$file."</a>"." 创建时间：".date("Y-m-d H:i:s",filectime($file))." 修改时间：".date("Y-m-d H:i:s",filemtime($file))." <a href=?readfile={$file} target='_blank'>源码</a><a href='http://www.gimoo.net/t/1512/&' target='_blank'>删除</u></a><br />"; 
  }else{ 
   if($log[$file] != $md5){ 
   echo "修改文件：<a href={$file} target='_blank'>".$file."</a>"." 创建时间：".date("Y-m-d H:i:s",filectime($file))." 修改时间：".date("Y-m-d H:i:s",filemtime($file))." <a href=?readfile={$file} target='_blank'>源码</a><br />"; 
   unset($log[$file]); 
   }else{ 
   unset($log[$file]); 
   } 
  } 
  } 
  } 
  if(count($log)>0){ 
  foreach($log as $file => $md5){ 
  echo "删除文件：<a href={$file} target='_blank'>".$file."</a><br />"; 
  } 
  } 
  } 
} 
} 
} 
//计算md5 
function record_md5($jkdir){ 
    global $file_list,$exclude; 
    if(is_dir($jkdir)){ 
        $file=scandir($jkdir); 
        foreach($file as $f){ 
            if($f!='.' && $f!='..' && !in_array($f, $exclude)){ 
                $path = $jkdir.'/'.$f; 
                if(is_dir($path)){ 
                    record_md5($path); 
                }else{ 
                    $file_list[$path]=md5_file($path); 
                } 
            } 
        } 
    } 
} 
function Safe_Check($jkdir)//遍历文件 
{ 
global $danger ,$suffix ,$jkdir_num ,$file_num ,$danger_num; 
) or die('文件夹不存在') ; 
while ($file=$hand->read()) 
{ 
  $filename=$jkdir.'/'.$file; 
  if (!$jumpoff) { 
  if(Jump($filename))continue; 
  } 
  if(@is_dir($filename) && $file != '.' && $file!= '..'&& $file!='./..') 
  {  $jkdir_num++; 
  Safe_Check($filename); 
  } 
  if (preg_match_all ("/.($suffix)/i",$filename,$out)) 
  { 
  $str=''; 
  $fp = @fopen($filename,'r')or die('没有权限'); 
  while(!feof($fp)) 
  { 
  $str .= fgets($fp,1024); 
  } 
  fclose($fp); 
  if( preg_match_all ("/($danger)[ rnt]{0,}([[(])/i",$str,$out)) 
  { 
  echo "<font color='green' style='font-size:14px'>可疑文件：{$filename}</font>"." 创建时间：".date("Y-m-d H:i:s",filectime($filename))." 修改时间：".date("Y-m-d H:i:s",filemtime($filename))." <a href='http://www.gimoo.net/t/1512/&' target='_blank'><u>查看代码</u></a> <a href='http://www.gimoo.net/t/1512/&' target='_blank'>删除</u></a><br>"; 
  $danger_num++; 
  } 
  } 
  $file_num++; 
} 
} 
function Edit()//查看可疑文件 
{ 
global $filename; 
$filename = str_replace("..","",$filename); 
$file = $filename; 
$content = ""; 
if(is_file($file)) 
{ 
  $fp = fopen($file,"r")or die('没有权限'); 
  $content = fread($fp,filesize($file)); 
  fclose($fp); 
  $content = htmlspecialchars($content); 
} 
echo "<textarea name='str' style='width:100%;height:450px;background:#cccccc;'>$content</textarea>rn"; 
exit(); 
} 
function Delete()//删除文件 
{ global $filename,$pass; 
if(empty($_POST['passchack'])){ 
  echo"<form id="form1" name="form1" method="post">" 
  . " <label>pass" 
  . " <input type="text" name="passchack" />" 
  . " </label>" 
  . " <input type="submit" name="Submit" value="提交" />" 
  . "</form>" 
  .""; 
  exit; 
}elseif(isset($_POST['passchack'])&&$_POST['passchack']==$pass){ 
  (is_file($filename))?($mes=unlink($filename)?'删除成功':'删除失败 查看权限'):''; 
  echo $mes; 
  exit(); 
}else{ 
  echo '密码错误！'; 
  exit; 
} 
} 
function Jump($file)//跳过文件 
{ 
global $jump,$safearr; 
if($jump != '') 
{ 
  foreach($safearr as $v) 
  { 
  if($v=='') continue; 
  if( eregi($v,$file) ) return true ; 
  } 
} 
return false; 
} 
?> 
<a href="http://www.gimoo.net/t/1512/scandir.php">[查看文件改动]</a>|<a href="http://www.gimoo.net/t/1512/scandir.php&">[保存当前文件指纹]</a>|<a href="http://www.gimoo.net/t/1512/scandir.php&">[扫描可疑文件]</a>

以上代码就是php web木马扫描器代码分享，本文附有注释，有不明白的欢迎给我留言，相信实现方法也不止以上一种，欢迎大家多多分享不同的实现方法。